MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Bacillus thuringiensis Bt407 plasmid BTB_7p

Total Repeats: 189

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_018882	AAGG	2	8	26	33	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
2	NC_018882	T	6	6	64	69	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_018882	AT	3	6	90	95	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_018882	AGA	2	6	183	188	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	514403574
5	NC_018882	TGAG	2	8	192	199	25 %	25 %	50 %	0 %	514403574
6	NC_018882	GA	3	6	205	210	50 %	0 %	50 %	0 %	514403574
7	NC_018882	AAAAAG	2	12	260	271	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	514403574
8	NC_018882	CAA	2	6	357	362	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	514403574
9	NC_018882	GAA	2	6	383	388	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	514403574
10	NC_018882	AAGA	2	8	389	396	75 %	0 %	25 %	0 %	514403574
11	NC_018882	TTTCT	2	10	398	407	0 %	80 %	0 %	20 %	514403574
12	NC_018882	TAA	2	6	466	471	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	514403574
13	NC_018882	TAA	2	6	478	483	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	514403574
14	NC_018882	ATT	2	6	484	489	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	514403574
15	NC_018882	TCA	2	6	564	569	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	514403574
16	NC_018882	GAA	2	6	572	577	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	514403574
17	NC_018882	AAC	2	6	584	589	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	514403574
18	NC_018882	A	7	7	693	699	100 %	0 %	0 %	0 %	514403574
19	NC_018882	GAA	2	6	734	739	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	514403574
20	NC_018882	TTTA	2	8	900	907	25 %	75 %	0 %	0 %	514403574
21	NC_018882	AATT	2	8	924	931	50 %	50 %	0 %	0 %	514403574
22	NC_018882	A	6	6	962	967	100 %	0 %	0 %	0 %	514403574
23	NC_018882	TAT	3	9	1016	1024	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	514403574
24	NC_018882	TGAT	2	8	1119	1126	25 %	50 %	25 %	0 %	514403574
25	NC_018882	A	6	6	1153	1158	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
26	NC_018882	GAA	2	6	1198	1203	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
27	NC_018882	TGA	2	6	1302	1307	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
28	NC_018882	AG	3	6	1322	1327	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
29	NC_018882	TC	3	6	1353	1358	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
30	NC_018882	T	6	6	1359	1364	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
31	NC_018882	GAAA	2	8	1370	1377	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
32	NC_018882	GCA	2	6	1389	1394	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
33	NC_018882	A	6	6	1437	1442	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
34	NC_018882	T	6	6	1446	1451	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
35	NC_018882	TTAAAT	2	12	1453	1464	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
36	NC_018882	ATTT	2	8	1479	1486	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
37	NC_018882	AT	3	6	1504	1509	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
38	NC_018882	TGA	2	6	1517	1522	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
39	NC_018882	TAC	2	6	1531	1536	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
40	NC_018882	T	7	7	1571	1577	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
41	NC_018882	AT	3	6	1580	1585	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
42	NC_018882	T	6	6	1609	1614	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
43	NC_018882	T	6	6	1619	1624	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
44	NC_018882	TTTA	2	8	1678	1685	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
45	NC_018882	TA	3	6	1778	1783	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
46	NC_018882	A	6	6	1809	1814	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
47	NC_018882	TG	3	6	1881	1886	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
48	NC_018882	A	7	7	1889	1895	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
49	NC_018882	TGT	2	6	1919	1924	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
50	NC_018882	T	6	6	1934	1939	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
51	NC_018882	AT	3	6	2042	2047	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
52	NC_018882	AT	3	6	2050	2055	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
53	NC_018882	ATG	2	6	2078	2083	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
54	NC_018882	A	6	6	2084	2089	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
55	NC_018882	A	6	6	2105	2110	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
56	NC_018882	TGA	2	6	2114	2119	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
57	NC_018882	T	6	6	2131	2136	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
58	NC_018882	TTTA	2	8	2144	2151	25 %	75 %	0 %	0 %	514403575
59	NC_018882	TC	3	6	2186	2191	0 %	50 %	0 %	50 %	514403575
60	NC_018882	TTA	2	6	2226	2231	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	514403575
61	NC_018882	AATA	2	8	2307	2314	75 %	25 %	0 %	0 %	514403575
62	NC_018882	TTTG	2	8	2322	2329	0 %	75 %	25 %	0 %	514403575
63	NC_018882	T	6	6	2341	2346	0 %	100 %	0 %	0 %	514403575
64	NC_018882	GTTA	2	8	2441	2448	25 %	50 %	25 %	0 %	514403576
65	NC_018882	AGT	2	6	2452	2457	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	514403576
66	NC_018882	T	6	6	2467	2472	0 %	100 %	0 %	0 %	514403576
67	NC_018882	TAG	2	6	2522	2527	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	514403576
68	NC_018882	GTT	2	6	2543	2548	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	514403576
69	NC_018882	TTCT	2	8	2569	2576	0 %	75 %	0 %	25 %	514403576
70	NC_018882	T	6	6	2584	2589	0 %	100 %	0 %	0 %	514403576
71	NC_018882	T	7	7	2690	2696	0 %	100 %	0 %	0 %	514403576
72	NC_018882	TA	3	6	2702	2707	50 %	50 %	0 %	0 %	514403576
73	NC_018882	CAA	2	6	2783	2788	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
74	NC_018882	AAT	2	6	2800	2805	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
75	NC_018882	TTTAA	2	10	2821	2830	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
76	NC_018882	TAAA	3	12	2849	2860	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
77	NC_018882	ATAA	2	8	2861	2868	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
78	NC_018882	TA	3	6	2878	2883	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
79	NC_018882	TTTAA	2	10	2891	2900	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
80	NC_018882	ATA	2	6	2920	2925	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
81	NC_018882	T	6	6	2929	2934	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
82	NC_018882	A	6	6	2991	2996	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
83	NC_018882	A	6	6	3030	3035	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
84	NC_018882	A	6	6	3066	3071	100 %	0 %	0 %	0 %	514403577
85	NC_018882	AGT	2	6	3076	3081	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	514403577
86	NC_018882	AT	3	6	3268	3273	50 %	50 %	0 %	0 %	514403577
87	NC_018882	AAT	2	6	3294	3299	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	514403577
88	NC_018882	ATG	2	6	3333	3338	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
89	NC_018882	TCTT	2	8	3447	3454	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
90	NC_018882	TGTT	2	8	3459	3466	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
91	NC_018882	TG	3	6	3567	3572	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
92	NC_018882	TGG	2	6	3598	3603	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
93	NC_018882	TGA	2	6	3607	3612	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
94	NC_018882	A	6	6	3619	3624	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
95	NC_018882	T	7	7	3646	3652	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
96	NC_018882	ATAC	2	8	3685	3692	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
97	NC_018882	CAC	2	6	3785	3790	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
98	NC_018882	T	6	6	3827	3832	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
99	NC_018882	GAAT	2	8	3849	3856	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
100	NC_018882	A	7	7	3981	3987	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
101	NC_018882	AGT	2	6	4003	4008	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
102	NC_018882	AT	3	6	4072	4077	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
103	NC_018882	GAG	2	6	4100	4105	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
104	NC_018882	CGGA	2	8	4132	4139	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
105	NC_018882	ATG	2	6	4156	4161	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
106	NC_018882	TTC	2	6	4206	4211	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
107	NC_018882	CGG	2	6	4361	4366	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
108	NC_018882	GAA	2	6	4444	4449	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
109	NC_018882	AAAG	2	8	4543	4550	75 %	0 %	25 %	0 %	514403578
110	NC_018882	ATT	2	6	4567	4572	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	514403578
111	NC_018882	GAAC	2	8	4576	4583	50 %	0 %	25 %	25 %	514403578
112	NC_018882	AAAAG	2	10	4612	4621	80 %	0 %	20 %	0 %	514403578
113	NC_018882	ATTC	2	8	4635	4642	25 %	50 %	0 %	25 %	514403578
114	NC_018882	TGT	2	6	4695	4700	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	514403578
115	NC_018882	TTG	2	6	4701	4706	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	514403578
116	NC_018882	TGTT	2	8	4785	4792	0 %	75 %	25 %	0 %	514403578
117	NC_018882	T	6	6	4791	4796	0 %	100 %	0 %	0 %	514403578
118	NC_018882	GAGAA	2	10	4811	4820	60 %	0 %	40 %	0 %	514403578
119	NC_018882	TGA	2	6	4845	4850	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	514403578
120	NC_018882	A	6	6	4850	4855	100 %	0 %	0 %	0 %	514403578
121	NC_018882	AAAAAC	2	12	4892	4903	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	514403578
122	NC_018882	T	6	6	4918	4923	0 %	100 %	0 %	0 %	514403578
123	NC_018882	GTG	2	6	5000	5005	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	514403578
124	NC_018882	CAA	2	6	5059	5064	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	514403578
125	NC_018882	AGAA	2	8	5090	5097	75 %	0 %	25 %	0 %	514403578
126	NC_018882	ATAG	2	8	5098	5105	50 %	25 %	25 %	0 %	514403578
127	NC_018882	AGA	2	6	5214	5219	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	514403578
128	NC_018882	TCT	2	6	5248	5253	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	514403578
129	NC_018882	AAGATT	2	12	5293	5304	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	514403578
130	NC_018882	GAT	2	6	5317	5322	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	514403578
131	NC_018882	TA	3	6	5324	5329	50 %	50 %	0 %	0 %	514403578
132	NC_018882	T	6	6	5340	5345	0 %	100 %	0 %	0 %	514403578
133	NC_018882	AG	3	6	5371	5376	50 %	0 %	50 %	0 %	514403578
134	NC_018882	GAAG	2	8	5388	5395	50 %	0 %	50 %	0 %	514403578
135	NC_018882	TGA	3	9	5541	5549	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	514403578
136	NC_018882	GAA	2	6	5593	5598	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	514403578
137	NC_018882	CAA	2	6	5599	5604	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	514403578
138	NC_018882	GAA	2	6	5624	5629	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	514403578
139	NC_018882	GA	3	6	5659	5664	50 %	0 %	50 %	0 %	514403578
140	NC_018882	ATT	2	6	5677	5682	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	514403579
141	NC_018882	CAA	2	6	5687	5692	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	514403579
142	NC_018882	AAT	2	6	5762	5767	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	514403579
143	NC_018882	TGA	2	6	5815	5820	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	514403579
144	NC_018882	ATGA	2	8	5873	5880	50 %	25 %	25 %	0 %	514403579
145	NC_018882	ATGA	2	8	5936	5943	50 %	25 %	25 %	0 %	514403579
146	NC_018882	TGT	2	6	5947	5952	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	514403579
147	NC_018882	AAT	2	6	5976	5981	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	514403579
148	NC_018882	AGG	2	6	5990	5995	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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187	NC_018882	TCT	2	6	7502	7507	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	514403582
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.